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== プロトコール集 ==

=== 植物の育成 ===
*シロイヌナズナ
**[[ムラシゲ・スクーグ培地の作製]]
**[[種まき]]
**[[栽培室での植物の育成（土植え、生育）]]
**[[種とり]]
**[[温室での育成]] 久野

=== 植物の観察 ===
*[[シロイヌナズナのGUS染色]]


=== クンショウモの育成 ===

:*[[C培地の作成 (クンショウモの育成)]]

=== 細菌の実験 ===
:*[[アグロバクテリウムの形質転換]]

=== 植物の観察 ===

=== DNAの実験 ===
==== 抽出・精製 ====
* [[シロイヌナズナの遺伝子型の判定]]
* [[イネ種子からのDNA抽出方法]] 寺島
:*[[～2015/6/16 までのもの]]
* [[トマト葉からのDNA抽出方法]] 佐藤
* [[NucleoSpin Plant IIを使ったDNA抽出]] 下里
* [[エタノール沈殿]]
* [[NucleoSpin Gel and PCR Clean-upを使ったDNA精製]]
* [[NucleoSpin Plasmid Quick Pureを使ったプラスミド抽出]]
* [[NucleoSpin Plasmid EasyPureを使ったプラスミド抽出]]

==== プラスミド作成 ====
* [[塩基置換を導入する QuickChange Multi Site-Directed Mutagenesis Kis]]
* [[インバースPCR]] 緋田
* [[TAクローニング]]　(TArget Clone -Plus- [Toyobo])
* [[In-Fusion Cloning]]
* [[大腸菌DH5aの形質転換]]

==== 解析 ====
* [[制限酵素でDNAを切断する]]
* [[トマトSNPマーカーの解析]]
* [[MightyAmpを使ったPCR]]
* [[LA Taqを使ったPCR]]
* [[EmeraldAmpを使ったコロニーPCR]]
* [[BigDye Terminaterを使ったシークエンス]]
* [[シロイヌナズナのゲノム編集について：概要、変異アリルの検出・同定]]
::* [[ゲノム編集した植物のシークエンスの解析]]
* [[ストレプトアビジンビーズを使った精製]]
* [[DNAの電気泳動]]
* [[DNAの電気泳動 (Old Ver.)]]
* [[MultiNAを使った電気泳動]]
* [[MultiNAを使った電気泳動 (Old Ver.2)]]

==== 定量 ====
* [[DNAの定量 (Promega QuantiFluor)]]
* [[DNAの定量 (DS-11 FX+)]]
* [[DNAの定量 (NanoVue)]]

=== RNAの実験 ===
* [[NucleoSpin RNA Plantを使ったRNA抽出]]
RNAの定量方法
*(a)吸光度(UV)で測定する場合　⇒ [[DNAの定量 (DS-11 FX+)]] を参照　
*(b)蛍光色素を用いる場合　⇒ [[RNAの定量 (invitrogen Quant-iT RiboGreen RNA Reagent and Kit)]]

=== タンパク質の実験 ===

=== 各種試薬の作製方法 ===
* [[各種試薬の作製方法（覚え書き）]]

=== 次世代シーケンサー ===
* [[TruSeq Nano DNA Library Prep Kit]]
* [[NEBNext Ultra RNA Library Prep Kit]]
* [[NEBNext Ultra II RNA Library Prep Kit]]
* [[NEBNext Multiplex Oligos for Illumina]]
* [[トマトSNPマーカーのライブラリ化]]
* [[RAD-Seqのライブラリ作成]]
* [[長いPCR産物のライブラリ作成]]

=== データ解析 ===
* [[ImageJ 動画の作成]]

== 研究室のルール ==
* [[全般 (最初に読む)]]
* [[実験ノートの書き方]]
* [[実験室の掃除：定期清掃、大掃除]]

=== 実験装置の使い方 ===
* [[SYNERGY H1]] (プレートリーダー)
* [[生物発光測定装置]]

=== コンピュータの使い方 ===
* [[ネットワークへの接続方法]]
* [[プリンターの使用方法]]
* [[共有ハードディスクの利用方法]] 寺島
* [[メーリングリストの利用方法]]
* [[P-touchの使用方法]]

=== その他 ===
* [[温室停電対策]]
* [[停電対策メモ：９階関連（温室以外）]]
* [[産廃の処理方法]]

=== お知らせ ===
* [[2015/12/1 三年生就職]]


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