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[編集] プロトコール集
[編集] 植物の育成
- シロイヌナズナ
[編集] 植物の観察
[編集] クンショウモの育成
[編集] 細菌の実験
[編集] DNAの実験
[編集] 抽出・精製
- トマト葉からのDNA抽出方法 佐藤
- NucleoSpin Plant IIを使ったDNA抽出 下里
- エタノール沈殿
- NucleoSpin Gel and PCR Clean-upを使ったDNA精製
- NucleoSpin Plasmid Quick Pureを使ったプラスミド抽出
- NucleoSpin Plasmid EasyPureを使ったプラスミド抽出
- NucleoBond Xtra Midiを使ったプラスミド抽出 (Midi Prep.)
[編集] プラスミド作成
- クローニング KOD Plus
- 塩基置換を導入する QuickChange Multi Site-Directed Mutagenesis Kis
- インバースPCR 緋田
- TAクローニング (TArget Clone -Plus- [Toyobo])
- In-Fusion Cloning
- 大腸菌DH5aの形質転換
[編集] 解析
- 制限酵素でDNAを切断する
- トマトSNPマーカーの解析
- MightyAmpを使ったPCR
- LA Taqを使ったPCR
- EmeraldAmpを使ったコロニーPCR
- BigDye Terminaterを使ったシークエンス
- シロイヌナズナのゲノム編集について：概要、変異アリルの検出・同定
[編集] 定量
[編集] RNAの実験
RNAの定量方法
- (a)吸光度(UV)で測定する場合 ⇒ DNAの定量 (DS-11 FX+) を参照
- (b)蛍光色素を用いる場合 ⇒ RNAの定量 (invitrogen Quant-iT RiboGreen RNA Reagent and Kit)
[編集] タンパク質の実験
[編集] 各種試薬の作製方法
- 各種試薬の作製方法（覚え書き） ：SOC培地、MES-KOH、B5 vitamin、種子滅菌液 など
[編集] 次世代シーケンサー
- NEBNext Ultra II DNA Library Prep Kit
- TruSeq Nano DNA Library Prep Kit
- NEBNext Ultra II RNA Library Prep Kit Ver. 240630
- NEBNext Ultra RNA Library Prep Kit
- NEBNext Ultra II RNA Library Prep Kit 丹羽(修正)
- NEBNext Multiplex Oligos for Illumina
- トマトSNPマーカーのライブラリ化
- RAD-Seqのライブラリ作成
- 長いPCR産物のライブラリ作成
[編集] データ解析
[編集] 研究室のルール
[編集] 実験装置の使い方
- SYNERGY H1 (プレートリーダー)
- 生物発光測定装置
[編集] コンピュータの使い方
[編集] その他
[編集] お知らせ
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