DNAの電気泳動
提供: 鈴木研Wiki
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2017年10月13日 (金) 16:50時点における版
目次 |
アガロースを使った電気泳動
用意するもの(全量20µの場合)
- 抽出したDNAサンプル 1µℓ
- Might Amp 0.1µℓ
- 2×MightAmp Buffer 10µℓ
- プライマーmix (2600,8600,8800,9350) 各2µℓ
- 水 6.9µℓ
- 1%アガロースゲル
- GR RED Loading buffer, 6X 1μℓ
- DNAマーカー 4μℓ
サンプルDNAをPCRで増やす
- 抽出したDNAサンプル、Might Amp、2×MightAmp Buffer、プライマーMix、水の合計20μℓを8連マイクロチューブに20μピペットマンで入れ遠心する。
- 必要数サンプルが出来たら20μサンプルをPCRにかけて反応させる。
- 95℃ 5分
- 95℃ 1分
- 70or75℃ 1分
- 72℃ 4分
- 72℃ 7分
- 35サイクル
- 12℃ ∞
PCRが終ったら4℃で1日保存する
増やしたDNAを電気泳動で確認する
- 用意した1%アガロースゲルを電気泳動装置にセットし、1×TAEバッファーをゲルが浸るまで加える
- アガロースゲルの一番左のウェルにDNAマーカー4μℓを20μピペットマンでアプライする。
- 前日用意したPCR産物を別の8連マイクロチューブに4μℓ取りその中にGR RED Loading bufferを1μ加えて遠心する。(全量5μℓ)
- できたサンプル5μℓ全量をアガロースゲルにそれぞれアプライする。
- マーカー及びサンプルをすべてゲルにアプライしたら電気泳動を開始する(10分から20分程度)
- 電気泳動が終了したらゲルを電気泳動装置から取り出しUV透過ゲルトレイに乗せ電気泳動ゲル撮影用デジタルカメラ遮光フード装置に持っていき撮影する。(結果を確認するまでゲルは捨てないこと)
- 撮影したデータを持ってパソコンに保存、印刷する。