DNAの電気泳動

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(アガロースゲルの作製と電気泳動)
(アガロースゲルの作製と電気泳動)
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#
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{| class='wikitable'
#必要数サンプルが出来たら20μサンプルをPCRにかけて反応させる。
+
|アガロースの濃度||DNAのサイズ
:::95℃ 5分
+
|-
:::95℃ 1分
+
|0.6%|| style="text-align:right;"| 1,000~20,000
:::70or75℃ 1分
+
|-
:::72℃ 4分
+
|0.7%|| style="text-align:right;"|800~10,000
:::72℃ 7分
+
|-
:::35サイクル
+
|1.0%|| style="text-align:right;"|500~7,000
:::12℃ ∞
+
|-
PCRが終ったら4℃で1日保存する
+
|1.2%|| style="text-align:right;"|400~6,000
 +
|-
 +
|1.5%|| style="text-align:right;"|200~3,000
 +
|-
 +
|2.0%|| style="text-align:right;"|100~2,000
 +
|-
 +
|}
 +
 
 
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2017年11月24日 (金) 15:36時点における版

目次

アガロースを使った電気泳動

試薬

  • 1×TAE(50×TAEを50倍希釈)
  • TAKARA Agarose 
  • 2×MightAmp Buffer  10µℓ 
  • GR RED Loading buffer 6×
  • DNAマーカー

アガロースゲルの作製と電気泳動

アガロースの濃度 DNAのサイズ
0.6% 1,000~20,000
0.7% 800~10,000
1.0% 500~7,000
1.2% 400~6,000
1.5% 200~3,000
2.0% 100~2,000

増やしたDNAを電気泳動で確認する

  1. 用意した1%アガロースゲルを電気泳動装置にセットし、1×TAEバッファーをゲルが浸るまで加える
  2. アガロースゲルの一番左のウェルにDNAマーカー4μℓを20μピペットマンでアプライする。
  3. 前日用意したPCR産物を別の8連マイクロチューブに4μℓ取りその中にGR RED Loading bufferを1μ加えて遠心する。(全量5μℓ)
  4. できたサンプル5μℓ全量をアガロースゲルにそれぞれアプライする。
  5. マーカー及びサンプルをすべてゲルにアプライしたら電気泳動を開始する(10分から20分程度)
  6. 電気泳動が終了したらゲルを電気泳動装置から取り出しUV透過ゲルトレイに乗せ電気泳動ゲル撮影用デジタルカメラ遮光フード装置に持っていき撮影する。(結果を確認するまでゲルは捨てないこと)
  7. 撮影したデータを持ってパソコンに保存、印刷する。
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