DNAの電気泳動
提供: 鈴木研Wiki
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|アガロースの濃度(W/V)||DNAのサイズ(bp) | |アガロースの濃度(W/V)||DNAのサイズ(bp) | ||
2019年12月18日 (水) 17:31時点における版
目次 |
アガロースを使った電気泳動
試薬
- 1×TAE（50×TAEを50倍希釈）
- TAKARA Agarose
- GR RED Loading buffer 6×
- DNA分子量マーカー
アガロースゲルの作製
| アガロースの濃度(W/V) | DNAのサイズ(bp) |
| 0.6% | 1,000～20,000 |
| 0.7% | 800～10,000 |
| 1.0% | 500～7,000 |
| 1.2% | 400～6,000 |
| 1.5% | 200～3,000 |
| 2.0% | 100～2,000 |
- (目安) 1kb以下：1.5%、1kb以上：0.7%
- ゲルトレーを準備する。
- トレーのサイズに応じたTAEを三角フラスコに分注する。
- アガロースを量って入れる。
- 電子レンジでアガロースを完全に溶かす。
- 水道水でアガロース溶液を素手で持てるぐらいまで冷やす。
- トレーにアガロースを流し込む。コームをさす。
- 固まるのを待つ。すぐに使わない場合は、冷蔵庫で保存
電気泳動
- サンプルとにGR RED Loading bufferを4μl加えて遠心する。
- 泳動層にトレーを入れ、TAEを満たす。
- サンプル10μlと左端にマーカー5μl(GR RED 1μl+マーカー4μl)をアプライし、100Vで泳動する。
- 泳動が終了したら、ゲルをUV透過ゲルトレイに乗せ、トランスイルミネーターでDNAを可視化する。写真を撮る。
- SDカードから撮影したデータを保存する。
