イネ種子からのDNA抽出方法

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(ページの作成:「====用いる器具・試薬==== ---- '''試料・試薬''' * 米粒 1粒 * PL1 400μl * PC 450μl * PW1 400μl * PW2 900μl * PE 100μl * RNaseA 10μl '''器...」)
 
 
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イネ種子からDNA抽出し、精製する
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====用いる器具・試薬====
 
====用いる器具・試薬====
 
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* 米粒 1粒
 
* 米粒 1粒
  
* PL1  400μl
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* SolⅠ 200μl
  
* PC 450μl
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* SolⅡ 20μl
  
* PW1 400μl
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* SolⅢ 75μl
  
* PW2 900μl
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* クロロホルム 100μl
  
* PE 100μl  
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* イソプロパノール 100μl
  
* RNaseA 10μl
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* 70%エタノール 100μl
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* H2O 100μl
  
 
'''器具'''
 
'''器具'''
  
 
* メタルコーン 1つ
 
* メタルコーン 1つ
 
* フィルター 2種類 (<span style="color:purple">紫</span> ・<span style="color:green">緑</span> )
 
  
 
* エッペン管 1個
 
* エッペン管 1個
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* 2mlサンプルチューブ 1個
  
 
* 20μl用ピペットマン
 
* 20μl用ピペットマン
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1. 米粒(一粒)とメタルコーンを2mlサンプルチューブに入れて、MULTI-BEADS SHOCKER(YASUIKIKAI)を用いて2000rpmで20秒×2回サンプルを破砕する
 
1. 米粒(一粒)とメタルコーンを2mlサンプルチューブに入れて、MULTI-BEADS SHOCKER(YASUIKIKAI)を用いて2000rpmで20秒×2回サンプルを破砕する
  
2. PL1 400μl と RNaseA 10μl を加える''''' <span style="color:red">注意:手袋着用して行うこと</span> '''''
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2. SolⅠ 200μl と SolⅡ 20μl と SolⅢ 75μl を加え、その都度、ボルテックスを行う
 
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3. ヒートブロック(65℃)で10分熱処理し、軽く遠心する
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4. ピペットマンを使用して内液をフィルター'''(<span style="color:purple">紫</span>)'''に流しいれ、遠心分離機(11000xg)で2分遠心する
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5. フィルターの'''<span style="color:red">上(層部分)</span>''' を捨て、下(液部分)に PC 450μl を加え、ピペッティングする
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6. ピペットマンで新しいフィルター'''(<span style="color:green">緑</span>)'''に流しいれ、遠心分離機(11000xg)で1分遠心する''''' <span style="color:red">注意:液量が多いため、2回に分けること</span> '''''
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7. PW1 400μl を加え、遠心分離機(11000xg)で1分遠心する
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8. PW2 700μl を加え、遠心分離機(11000xg)で1分遠心する
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9. PW2 200μl を加え、遠心分離機(11000xg)で2分遠心する
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''''' <span style="color:blue">フィルターの下(液部分)があふれるため、6~9の各工程が終わり次第、液を廃棄すること</span> '''''
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3. ヒートブロック(50℃)で15分熱処理する
  
10. フィルターの'''<span style="color:red">下(液部分)</span>''' を捨て、上(層部分)をエッペン管につける
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4. クロロホルム 100μl を加え、遠心分離機(15000rpm)で5分遠心する
  
11. PE 50μl を加える
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5. 上澄み液をエッペン管に回収し、イソプロパノール 100μl を加え、ボルテックス後、遠心分離機(15000rpm)で15分遠心する
  
12. ヒートブロック(65℃)で5分熱処理し、遠心分離機(11000xg)で1分遠心する
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6. 70%エタノール 100μl を加え、遠心分離機(15000rpm)で5分遠心する
  
13. PE 50μl を加え、遠心分離機(11000xg)で1分遠心する
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7. 液層を吸い出し、H2O 100μlを加え、1晩冷蔵保存する
  
14. フィルターを捨て、エッペン管を冷凍保存する。
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8. 冷凍保存する

2016年1月17日 (日) 15:56時点における最新版

イネ種子からDNA抽出し、精製する

[編集] 用いる器具・試薬


試料・試薬

  • 米粒 1粒
  • SolⅠ 200μl
  • SolⅡ 20μl
  • SolⅢ 75μl
  • クロロホルム 100μl
  • イソプロパノール 100μl
  • 70%エタノール 100μl
  • H2O 100μl

器具

  • メタルコーン 1つ
  • エッペン管 1個
  • 2mlサンプルチューブ 1個
  • 20μl用ピペットマン
  • 200μl用ピペットマン
  • 1000μl用ピペットマン
  • MULTI-BEADS SHOCKER(YASUIKIKAI)
  • ヒートブロック
  • 遠心分離機

[編集] 実験方法


1. 米粒(一粒)とメタルコーンを2mlサンプルチューブに入れて、MULTI-BEADS SHOCKER(YASUIKIKAI)を用いて2000rpmで20秒×2回サンプルを破砕する

2. SolⅠ 200μl と SolⅡ 20μl と SolⅢ 75μl を加え、その都度、ボルテックスを行う

3. ヒートブロック(50℃)で15分熱処理する

4. クロロホルム 100μl を加え、遠心分離機(15000rpm)で5分遠心する

5. 上澄み液をエッペン管に回収し、イソプロパノール 100μl を加え、ボルテックス後、遠心分離機(15000rpm)で15分遠心する

6. 70%エタノール 100μl を加え、遠心分離機(15000rpm)で5分遠心する

7. 液層を吸い出し、H2O 100μlを加え、1晩冷蔵保存する

8. 冷凍保存する

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