TAクローニング

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====使用するキット====
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===使用するキット===
 
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*「TArget Clone -Plus-」 (Toyobo)  @-20℃フリーザー
 
*「TArget Clone -Plus-」 (Toyobo)  @-20℃フリーザー
  
 
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===実験方法===
====実験方法====
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:1. マイクロチューブにPCR産物とPCR産物の2倍量のNT1を加える。
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====(1) PCR産物の調製====
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*精製したPCR産物を用いる場合、以下の要領で調製する。
  
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{| class="wikitable"
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!!! 添加量  !! 終濃度
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| dH2O|| style="text-align:right;"|1.66 µl || | -
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|-
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| KOD -Plus- 10x Buffer || style="text-align:right;"| 0.9 µl|| | 1x (10倍希釈)
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|-
 +
| 25mM MgSO4 || style="text-align:right;"| 0.54 µl|| | 1.5mM (16.6倍希釈)
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|-
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| 2mM dNTPs || style="text-align:right;"| 0.9 µl || | 0.2mM (10倍希釈)
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|-
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| <b>精製PCR産物</b> || style="text-align:right;"| 5 µl || | -
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|}
  
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最終濃度が1x Taqバッファー、1.5mM MgCl2、0.2mM dNTPsとなるように試薬を添加して、以下の操作を継続してください。
  
  
 
====実験方法(電気泳動後のゲルから抽出する場合)====
 
 
::*電気泳動後のゲルからバンドを切り出して精製する場合は、以下の方法で行う
 
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:1. 精製したいDNA(PCR産物など)をアガロースゲルで電気泳動する
 
:1. 精製したいDNA(PCR産物など)をアガロースゲルで電気泳動する
 
::*泳動バッファーは使い回しではなく新しいものを使用
 
::*泳動バッファーは使い回しではなく新しいものを使用
::*サンプルをウェルにアプライする時は、各サンプル間で1レーン以上間隔を開ける
+
::*サンプルをウェルに
::*電気泳動中は、光が当たらないように箱"Dark電気泳der"を泳動層にかぶせておく
+
:::※GR Redを取り込んだDNAは光が当たると変異が生じやすいため
+
  
:2. (電気泳動中にヒートブロックを50℃にセットしておく)
 
  
:3. 泳動が終わったら、UV(短波長)を当てて確認しながら、バンド部分のアガロースゲルをカミソリで切り出してエッペンに回収する(@トランスイルミネーター)
+
====(2) 3'末端のdA付加反応====
  
:4. 3で切り出したアガロースゲル100mg(≒100ul)に対して、NT1 200ulの割合になるようにNT1を加える
+
:1. 精製したいDNA(PCR産物など)をアガロースゲルで電気泳動する
 
+
::*泳動バッファーは使い回しではなく新しいものを使用
:5. 50度で5-10分熱処理して、ゲルを溶解する(完全に融けるまで)
+
::*サンプルをウェルに
 
+
(これ以降は、上記の「PCR産物の精製」と同じ)
+
:6. カラムをCollection Tube(2ml)にセットし、5の溶液をカラムに添加する。
+
::11,000×g で、30秒遠心する。
+
::ろ液を捨て、同じCollection Tubeにカラムをセットする。
+
  
:7. NT3 700μlをカラムに添加する。
 
::11,000×g で、30秒遠心する。
 
::ろ液を捨て、同じCollection Tubeにカラムをセットする。
 
:*このステップを2回行う。
 
  
:8. カラムを11,000×gで、1分遠心しメンブレンを乾燥させる。
 
  
:9. カラムをマイクロチューブにセットする。
+
====<以下、作成中>====
::NE15〜30μlを加え、室温で1分インキュベートする。
+
::※溶出時に使うNEの量は、次の操作などによって異なるので、実験前に先生に確認すること (たとえば...PCR産物50μl:30μl , PCR産物20μl:20μl。必ずこの量とは限らない) 
+
::11,000×gで、1分遠心する。
+

2020年2月19日 (水) 13:57時点における版

目次

使用するキット


  • 「TArget Clone -Plus-」 (Toyobo)  @-20℃フリーザー

実験方法


(1) PCR産物の調製

  • 精製したPCR産物を用いる場合、以下の要領で調製する。
添加量 終濃度
dH2O 1.66 µl -
KOD -Plus- 10x Buffer 0.9 µl 1x (10倍希釈)
25mM MgSO4 0.54 µl 1.5mM (16.6倍希釈)
2mM dNTPs 0.9 µl 0.2mM (10倍希釈)
精製PCR産物 5 µl -

最終濃度が1x Taqバッファー、1.5mM MgCl2、0.2mM dNTPsとなるように試薬を添加して、以下の操作を継続してください。


1. 精製したいDNA(PCR産物など)をアガロースゲルで電気泳動する
  • 泳動バッファーは使い回しではなく新しいものを使用
  • サンプルをウェルに


(2) 3'末端のdA付加反応

1. 精製したいDNA(PCR産物など)をアガロースゲルで電気泳動する
  • 泳動バッファーは使い回しではなく新しいものを使用
  • サンプルをウェルに


<以下、作成中>

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