MultiNAを使った電気泳動

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===＜使用方法＞===
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== (1) 装置の起動 ==
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# 本体の電源を入れる。
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# 制御用コンピュータを起動する。MultiNAユーザーでログインして、MultiNA装置制御を起動する。
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# 制御ソフトの左上のMultiNAの文字がオレンジのときは本体と通信できていないのでメニューの「装置」-「接続」を実行する。
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* 洗浄水の量を確認する。足りないときはElix水を補充する。
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::* 洗浄水が足らないとチップが詰まってしまうので、毎回のラン開始時、あるいは洗浄・クリーニング開始時には、必ずチェックする！
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* 廃液が一杯になっていないか、廃液チューブが正しくセットされているかを確認する。廃液はシンクに流す。
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== (2) クリーニング ==
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前日に使用していない場合は、全チップクリーニングをする。（※前日に使用している場合は、チップ洗浄を行う(2回:全チップ)）
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:::「装置」タブ → 「チップクリーニング」 → 「全チップ」　
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::* チップクリーニング液＝Cleaning Solution RA　（試薬棚）
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::* チップ4枚、2回洗浄の場合：クリーニング液使用量＝2.6ml（容器のラインまで）。所要時間＝70分。
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== (3) 試薬の解凍==
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*クリーニングを待っている間に、試薬を実験台の上に出して室温に戻しておく
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*解析するDNA断片の長さに合わせて、「DNA-500（水色）」「DNA-2500（紫）」「DNA-12000（ピンク）」のうち適切なキットを選ぶ。
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以下は、500bp以下のDNA断片を解析する際の「DNA-500（水色）」についての説明。
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::* ストック溶液の作製方法、「DNA-2500（紫）」「DNA-12000（ピンク）」の対応試薬は、末尾を参照）
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*(A) ラダー：pUC19/MspI(HpaII)　（-20℃で保存）
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*(B) 希釈色素液 SYBR Gold　（-20℃で保存）
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*(C) DNA マーカー溶液　：DNA-500用（水色）を使用（-20℃で保存）
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*(D) DNA 分離バッファ　：DNA-500用（水色）を使用 (4℃で保存)
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== (4) 測定 ==
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:1. 制御ソフトでサンプルの登録を行う。
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::1) MultiNA画面の「新規登録」をクリック
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::2) 使用するプロジェクト（キット、マーカー溶液の混合方法）を選択しOKをクリック
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::*「DNA-500」での解析には、基本的に「DNA-500_On-chip_1901」を使う
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::3) サンプルを配置するウェルをクリック（緑色に変わる）
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::4) ▶▶をクリック
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::5) （各ウェルのサンプル名を入力）
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::6) 登録をクリック
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:2. 分離バッファーとマーカーの必要量が表示されるので、調製して設置する。
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===＜試薬の調整方法＞===
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::*MultiNA装置の下の引き出しにある、試薬調製用のチューブを使う
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*(A) ラダー＝pUC19/MspI(HpaII) : ラダー用チューブ(200ulチューブ)に'12µl'分注する
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*(C) DNA マーカー溶液　：マーカー用チューブに表示された量＋10µl分注する
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する分離バッファー（希釈色素液と混合したもの）は専用のチューブに、マーカーは0.5mlチューブに分注して、
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::それぞれの蓋を開けて所定の位置に設置する。分離バッファーとマーカーのラベルの色と装置内の置き場所の色が同じ。
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::*分離バッファー、マーカー用の専用チューブは、MultiNAの下の引き出し内にあるものを使う
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::*分離バッファーは多めに作る。（足らない場合、ラン開始時にエラーが出る）
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:3. 自分のサンプルをセットする。サンプルは5µl以上必要で、そのうち1µlが使用される。
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:4. ラダーもセットする。ラダーは12µl程度必要。
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:5. サンプルを固定するための金属の網をかぶせる。
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:6. 蓋をする。
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:7. 制御用ソフトでランを開始する（▶をクリック）。泳動終了後に自動で洗浄を2回行うようにしておく。
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::*分離バッファー等の量が足らない場合、ラン開始してしばらく後にエラーが出る。その場合、補充したうえで再度ランを開始する
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=== (4) 試薬の調製===
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分離バッファー（希釈色素液と混合したもの）は専用のチューブに、マーカーは0.5mlチューブに分注して、
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::それぞれの蓋を開けて所定の位置に設置する。分離バッファーとマーカーのラベルの色と装置内の置き場所の色が同じ。
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::*分離バッファー、マーカー用の専用チューブは、MultiNAの下の引き出し内にあるものを使う
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::*分離バッファーは多めに作る。（足らない場合、ラン開始時にエラーが出る）
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*下記の「(5) 測定の2.」で調製する試薬について。必要な分離バッファーとマーカーの量が表示されるので、
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*MultiNA装置の下の引き出しにある、試薬調製用のチューブを使う
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表示される量の試薬を調製する
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2. 必要な分離バッファーとマーカーの量が表示されるので、分離バッファー（希釈色素液と混合したもの）は専用のチューブに、マーカーは0.5mlチューブに分注して、
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=== 後片付け ===
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* 一日の最後に全チップクリーニングを行う。チップクリーニングを行ったまま帰宅してよい（翌日に片付ける）。
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** 装置内にセットしたチューブをすべて回収。装置本体の電源を切る。
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* 分離バッファー、マーカーの容器は水洗いして、風乾。
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=== データの解析 ===
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データは自動で保存される。「MultiNA Viewer」で解析する
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:*(保存場所) デスクトップのショートカット「MultiNA-Project」内のプロジェクト毎のフォルダ内。登録時の日付が付いたファイルが作られる。
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==(1) 試薬==
 
==(1) 試薬==
 
解析するDNA断片の長さに合わせて、「DNA-500（水色）」「DNA-2500（紫）」「DNA-12000（ピンク）」のうち適切なキットを選び、それに合わせた試薬を用いる
 
解析するDNA断片の長さに合わせて、「DNA-500（水色）」「DNA-2500（紫）」「DNA-12000（ピンク）」のうち適切なキットを選び、それに合わせた試薬を用いる

2021年1月15日 (金) 12:20時点における版

＜使用方法＞

(1) 装置の起動

  1. 本体の電源を入れる。
  2. 制御用コンピュータを起動する。MultiNAユーザーでログインして、MultiNA装置制御を起動する。
  3. 制御ソフトの左上のMultiNAの文字がオレンジのときは本体と通信できていないのでメニューの「装置」-「接続」を実行する。
  • 洗浄水の量を確認する。足りないときはElix水を補充する。
  • 洗浄水が足らないとチップが詰まってしまうので、毎回のラン開始時、あるいは洗浄・クリーニング開始時には、必ずチェックする！
  • 廃液が一杯になっていないか、廃液チューブが正しくセットされているかを確認する。廃液はシンクに流す。

(2) クリーニング

前日に使用していない場合は、全チップクリーニングをする。（※前日に使用している場合は、チップ洗浄を行う(2回:全チップ)）

「装置」タブ → 「チップクリーニング」 → 「全チップ」　
  • チップクリーニング液＝Cleaning Solution RA　（試薬棚）
  • チップ4枚、2回洗浄の場合：クリーニング液使用量＝2.6ml（容器のラインまで）。所要時間＝70分。

(3) 試薬の解凍

  • クリーニングを待っている間に、試薬を実験台の上に出して室温に戻しておく
  • 解析するDNA断片の長さに合わせて、「DNA-500（水色）」「DNA-2500（紫）」「DNA-12000（ピンク）」のうち適切なキットを選ぶ。

以下は、500bp以下のDNA断片を解析する際の「DNA-500（水色）」についての説明。

  • ストック溶液の作製方法、「DNA-2500（紫）」「DNA-12000（ピンク）」の対応試薬は、末尾を参照）
  • (A) ラダー：pUC19/MspI(HpaII)　（-20℃で保存）
  • (B) 希釈色素液 SYBR Gold　（-20℃で保存）
  • (C) DNA マーカー溶液　：DNA-500用（水色）を使用（-20℃で保存）
  • (D) DNA 分離バッファ　：DNA-500用（水色）を使用 (4℃で保存)

(4) 測定

1. 制御ソフトでサンプルの登録を行う。
1) MultiNA画面の「新規登録」をクリック
2) 使用するプロジェクト（キット、マーカー溶液の混合方法）を選択しOKをクリック
  • 「DNA-500」での解析には、基本的に「DNA-500_On-chip_1901」を使う
3) サンプルを配置するウェルをクリック（緑色に変わる）
4) ▶▶をクリック
5) （各ウェルのサンプル名を入力）
6) 登録をクリック
2. 分離バッファーとマーカーの必要量が表示されるので、調製して設置する。

＜試薬の調整方法＞

  • MultiNA装置の下の引き出しにある、試薬調製用のチューブを使う
  • (A) ラダー＝pUC19/MspI(HpaII) : ラダー用チューブ(200ulチューブ)に'12µl'分注する
  • (C) DNA マーカー溶液　：マーカー用チューブに表示された量＋10µl分注する 
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する分離バッファー（希釈色素液と混合したもの）は専用のチューブに、マーカーは0.5mlチューブに分注して、

それぞれの蓋を開けて所定の位置に設置する。分離バッファーとマーカーのラベルの色と装置内の置き場所の色が同じ。
  • 分離バッファー、マーカー用の専用チューブは、MultiNAの下の引き出し内にあるものを使う
  • 分離バッファーは多めに作る。（足らない場合、ラン開始時にエラーが出る）
3. 自分のサンプルをセットする。サンプルは5µl以上必要で、そのうち1µlが使用される。
4. ラダーもセットする。ラダーは12µl程度必要。
5. サンプルを固定するための金属の網をかぶせる。
6. 蓋をする。
7. 制御用ソフトでランを開始する（▶をクリック）。泳動終了後に自動で洗浄を2回行うようにしておく。
  • 分離バッファー等の量が足らない場合、ラン開始してしばらく後にエラーが出る。その場合、補充したうえで再度ランを開始する

(4) 試薬の調製

分離バッファー（希釈色素液と混合したもの）は専用のチューブに、マーカーは0.5mlチューブに分注して、

それぞれの蓋を開けて所定の位置に設置する。分離バッファーとマーカーのラベルの色と装置内の置き場所の色が同じ。
  • 分離バッファー、マーカー用の専用チューブは、MultiNAの下の引き出し内にあるものを使う
  • 分離バッファーは多めに作る。（足らない場合、ラン開始時にエラーが出る）


  • 下記の「(5) 測定の2.」で調製する試薬について。必要な分離バッファーとマーカーの量が表示されるので、
  • MultiNA装置の下の引き出しにある、試薬調製用のチューブを使う

表示される量の試薬を調製する 2. 必要な分離バッファーとマーカーの量が表示されるので、分離バッファー（希釈色素液と混合したもの）は専用のチューブに、マーカーは0.5mlチューブに分注して、



後片付け

  • 一日の最後に全チップクリーニングを行う。チップクリーニングを行ったまま帰宅してよい（翌日に片付ける）。
    • 装置内にセットしたチューブをすべて回収。装置本体の電源を切る。
  • 分離バッファー、マーカーの容器は水洗いして、風乾。

データの解析

データは自動で保存される。「MultiNA Viewer」で解析する

  • (保存場所) デスクトップのショートカット「MultiNA-Project」内のプロジェクト毎のフォルダ内。登録時の日付が付いたファイルが作られる。



(1) 試薬

解析するDNA断片の長さに合わせて、「DNA-500（水色）」「DNA-2500（紫）」「DNA-12000（ピンク）」のうち適切なキットを選び、それに合わせた試薬を用いる

  • (A) ラダー　：キットに合わせて下記から選択。(2)で希釈したものを使う（-20℃で保存）
MultiNA用試薬 ラダー
DNA-500 pUC19 HpaII Digest (pUC19/MspI(HpaII)) ※25bp DNA ラダー から変更
DNA-2500 pGEM DNA Markers
DNA-12000 2-Log DNA Ladder (0.1-10.0 kbp)
  • (B) 希釈色素液 SYBR Gold　：(2)で希釈したものを使う（-20℃で保存）
  • (C) DNA マーカー溶液　：サイズに合わせたものを使用（-20℃で保存）
  • (D) DNA 分離バッファ　：サイズに合わせたものを使用 (4℃で保存)

(2) ストック溶液の作成

  • (A) ラダーを希釈する (-20℃で保存)
  1. (DNA-500) pUC19 HpaII Digest (pUC19/MspI(HpaII)) はTEで50倍に希釈する。
  2. (DNA-2500) pGEM DNA Markers はTEで100倍に希釈する。
  3. (DNA-12000) 2-Log DNA Ladder はTEで100倍に希釈する。
  • (B) 希釈色素液 (-20℃で保存)
  1. SYBR Gold 1µlとTE 99µlを混ぜ合わせる。

(3) 使用時に調整するもの

  • 希釈色素液を分離バッファーで100倍に希釈する。必要量はサンプルを設定した後計算されるが、以下を参考に調整してもよい。
合計分析数 8分析以下 9-29分析 30-79分析 80-120分析
分離バッファーの量 (µl) 495 990 1980 2970
希釈色素液の量 (µl) 5 10 20 30

(4) 使用方法

  1. 本体の電源を入れる。
  2. 制御用コンピュータを起動する。MultiNAユーザーでログインして、MultiNA装置制御を起動する。
  3. 制御ソフトの左上のMultiNAの文字がオレンジのときは本体と通信できていないのでメニューの「装置」-「接続」を実行する。
  • 洗浄水の量を確認する。足りないときはElix水を補充する。
  • 洗浄水が足らないとチップが詰まってしまうので、毎回のラン開始時、あるいは洗浄・クリーニング開始時には、必ずチェックする！
  • 廃液が一杯になっていないか、廃液チューブが正しくセットされているかを確認する。廃液はシンクに流す。

クリーニング

前日に使用していない場合は、全チップクリーニングをする。（※前日に使用している場合は、チップ洗浄を行う(2回)）

「装置」タブ → 「チップクリーニング」 → 「全チップ」
  • チップクリーニング液＝Cleaning Solution RA　（試薬棚）
  • チップ4枚、2回洗浄の場合：クリーニング液使用量＝2.6ml。所要時間＝70分。

測定

1. 制御ソフトでサンプルの登録を行う。
1) MultiNA画面の「新規登録」をクリック
2) 使用するプロジェクト（キット、マーカー溶液の混合方法）を選択しOKをクリック
3) ウェルをクリック（緑色に変わる）
4) ▶▶をクリック
5) サンプル名を入力
6) 登録をクリック
2. 必要な分離バッファーとマーカーの量が表示されるので、分離バッファー（希釈色素液と混合したもの）は専用のチューブに、マーカーは0.5mlチューブに分注して、
それぞれの蓋を開けて所定の位置に設置する。分離バッファーとマーカーのラベルの色と装置内の置き場所の色が同じ。
  • 分離バッファー、マーカー用の専用チューブは、MultiNAの下の引き出し内にあるものを使う
  • 分離バッファーは多めに作る。（足らない場合、ラン開始時にエラーが出る）
3. 自分のサンプルをセットする。サンプルは5µl以上必要で、そのうち1µlが使用される。
4. ラダーもセットする。ラダーは12µl程度必要。
5. サンプルを固定するための金属の網をかぶせる。
6. 蓋をする。
7. 制御用ソフトでランを開始する（▶をクリック）。泳動終了後に自動で洗浄を2回行うようにしておく。
  • 分離バッファー等の量が足らない場合、ラン開始してしばらく後にエラーが出る。その場合、補充したうえで再度ランを開始する

後片付け

  • 一日の最後に全チップクリーニングを行う。チップクリーニングを行ったまま帰宅してよい（翌日に片付ける）。
    • 装置内にセットしたチューブをすべて回収。装置本体の電源を切る。
  • 分離バッファー、マーカーの容器は水洗いして、風乾。

データの解析

データは自動で保存される。「MultiNA Viewer」で解析する

  • (保存場所) デスクトップのショートカット「MultiNA-Project」内のプロジェクト毎のフォルダ内。登録時の日付が付いたファイルが作られる。
「https://www.tsbio.info/labowiki/index.php?title=MultiNA%E3%82%92%E4%BD%BF%E3%81%A3%E3%81%9F%E9%9B%BB%E6%B0%97%E6%B3%B3%E5%8B%95&oldid=534」から取得
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