NucleoSpin Gel and PCR Clean-upを使ったDNA精製
提供: 鈴木研Wiki
2019年12月19日 (木) 10:52時点における157.110.120.101 (トーク)による版
試薬
- NucleoSpin Gel and PCR Clean-up
- NT1
- NT3(初めに使用する前に、エタノールを加える)
- NE
- PCR産物
実験方法(PCR産物の精製)
- 1. マイクロチューブにPCR産物とPCR産物の2倍量のNT1を加える。
- 2. カラムをCollection Tube(2ml)にセットし、1の溶液をカラムに添加する。
- 11,000×g で、30秒遠心する。
- ろ液を捨て、同じCollection Tubeにカラムをセットする。
- 3. NT3 700μlをカラムに添加する。
- 11,000×g で、30秒遠心する。
- ろ液を捨て、同じCollection Tubeにカラムをセットする。
- このステップを2回行う。
- 4. カラムを11,000×gで、1分遠心しメンブレンを乾燥させる。
- 5. カラムをマイクロチューブにセットする。
- NE15〜30μlを加え、室温で1分インキュベートする。
- ※溶出時に使うNEの量は、状況によって異なるので、実験前に先生に確認すること (たとえば...PCR産物50μl:30μl , PCR産物20μl:20μl。必ずこの量とは限らない)
- 11,000×gで、1分遠心する。
実験方法(電気泳動後のゲルから抽出する場合)
- 電気泳動後のゲルからバンドを切り出して精製する場合は、以下の方法で行う
- 1. 精製したいDNA(PCR産物など)をアガロースゲルで電気泳動する
- 泳動バッファーは使い回しではなく新しいものを使用
- サンプルをウェルにアプライする時は、各サンプル間で1レーン以上間隔を開ける
- 電気泳動中は、光が当たらないように箱"Dark電気泳der"を泳動層にかぶせておく
- ※GR Redを取り込んだDNAは光が当たると変異が生じやすいため
- 2. (電気泳動中にヒートブロックを50℃にセットしておく)
- 3. 泳動が終わったら、UV(短波長)を当てて確認しながら、バンド部分のアガロースゲルをカミソリで切り出してエッペンに回収する(@トランスイルミネーター)
- 4. 3で切り出したアガロースゲル100mg(≒100ul)に対して、NT1 200ulの割合になるようにNT1を加える
- 5. 50度で5-10分熱処理して、ゲルを溶解する(完全に融けるまで)
(これ以降は、上記の「PCR産物の精製」と同じ)
- 6. カラムをCollection Tube(2ml)にセットし、5の溶液をカラムに添加する。
- 11,000×g で、30秒遠心する。
- ろ液を捨て、同じCollection Tubeにカラムをセットする。
- 7. NT3 700μlをカラムに添加する。
- 11,000×g で、30秒遠心する。
- ろ液を捨て、同じCollection Tubeにカラムをセットする。
- このステップを2回行う。
- 8. カラムを11,000×gで、1分遠心しメンブレンを乾燥させる。
- 9. カラムをマイクロチューブにセットする。
- NE15〜30μlを加え、室温で1分インキュベートする。
- (PCR産物50μl・・・30μl , PCR産物20μl・・・20μl)
- 11,000×gで、1分遠心する。