ImageJ 動画の作成
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2018年5月8日 (火) 16:57時点における157.110.120.101 (トーク)による版
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[編集] 画像ファイルについて
名古屋大学イメージングセンターのCV1000を使って撮影した写真画像(ファイル名はW1F001T0001Z01C1.tifなど)。
Z軸に11枚、5分間隔で144枚(720分)撮影。C1は赤色の蛍光、C2は透過光
画像は一場面につき3168枚 (=144*11*2)。
[編集] ハイパースタックの作成
File - Import - Image Sequence... 最初の画像を選ぶ (W1F001T0001Z01C1.tif) Number of images: 3168 = T144 * Z11 * C2 Starting image: F002を開くときは3169とする
Image - Hyperstacks - Stack to Hyperstack... Order: xyczt (default) Channels: 2 Slices: 11 Frames: 144 Display Mode: Grayscale
[編集] 透過光と蛍光を分離
Image - Color - Split Channels
[編集] 透過光像の動画
[編集] 画質調整
Image - Adjust - Brightness/Contrast... Auto
[編集] 焦点面の選択
適当なZを選ぶ
Image - Hyperstacks - Reduce Dimensionality... Slicesのチェックをはずす
[編集] 保存
File - Save As - AVI
[編集] 蛍光像の動画
[編集] Z方向を重ねる
Image - Stacks - Z Project... Projection type: Max Intensity
[編集] 画質調整
Image - Adjust - Brightness/Contrast... Auto Image - Color - Channel Tools... More - Red
[編集] 保存
File - Save As - AVI... Compression: JPEG Frame Rate: 7
