DNAの電気泳動

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目次

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アガロースを使った電気泳動

試薬

  • 1×TAE(50×TAEを50倍希釈)
  • TAKARA Agarose
  • GR RED Loading buffer 6×
  • DNA分子量マーカー

アガロースゲルの作製

アガロースの濃度(W/V) DNAのサイズ(bp)
0.6% 1,000~20,000
0.7% 800~10,000
1.0% 500~7,000
1.2% 400~6,000
1.5% 200~3,000
2.0% 100~2,000
  • (目安) 1kb以下:1.5%、1kb以上:0.7%
  1. ゲルトレーを準備する。
  2. トレーのサイズに応じたTAEを三角フラスコに分注する。
  3. アガロースを量って入れる。
  4. 電子レンジでアガロースを完全に溶かす。
  5. 水道水でアガロース溶液を素手で持てるぐらいまで冷やす。
  6. トレーにアガロースを流し込む。コームをさす。
  7. 固まるのを待つ。すぐに使わない場合は、固まってから冷蔵庫で保存


電気泳動

  1. サンプルと10x泳動Bufferを混ぜて、

GR RED Loading bufferを4μl加えて遠心する。

  1. 泳動層にトレーを入れ、TAEを満たす。
  2. サンプル10μlと左端にマーカー5μl(GR RED 1μl+マーカー4μl)をアプライし、100Vで泳動する。
  3. 泳動が終了したら、ゲルをUV透過ゲルトレイに乗せ、トランスイルミネーターでDNAを可視化する。写真を撮る。
  4. SDカードから撮影したデータを保存する。
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