ImageJ 動画の作成

画像ファイルについて

名古屋大学イメージングセンターのCV1000を使って撮影した写真画像(ファイル名はW1F001T0001Z01C1.tifなど)。

Z軸に11枚、5分間隔で144枚(720分)撮影。C1は赤色の蛍光、C2は透過光

画像は一場面につき3168枚 (=144*11*2)。

ハイパースタックの作成

 File - Import - Image Sequence...
   最初の画像を選ぶ (W1F001T0001Z01C1.tif)
   Number of images: 3168 = T144 * Z11 * C2
   Starting image: F002を開くときは3169とする

 Image - Hyperstacks - Stack to Hyperstack...
   Order: xyczt (default)
   Channels: 2
   Slices: 11
   Frames: 144
   Display Mode: Grayscale

透過光と蛍光を分離

 Image - Color - Split Channels

透過光像の動画

画質調整

 Image - Adjust - Brightness/Contrast...
   Auto

焦点面の選択

適当なZを選ぶ

 Image - Hyperstacks - Reduce Dimensionality...
   Slicesのチェックをはずす

保存

 File - Save As - AVI

蛍光像の動画

Z方向を重ねる

 Image - Stacks - Z Project...
   Projection type: Max Intensity

画質調整

 Image - Adjust - Brightness/Contrast...
   Auto
 Image - Color - Channel Tools...
   More - Red

保存

 File - Save As - AVI...
   Compression: JPEG
   Frame Rate: 7