シロイヌナズナの遺伝子型の判定
提供: 鈴木研Wiki
2020年4月3日 (金) 09:19時点における157.110.120.101 (トーク)による版
試薬
- 0.4M NaOH
- 0.1M Tris-HCl pH 6.8
DNA抽出 マルチビーズショッカー
- 葉を一枚切り取り、サンプル破砕用チューブに入れる
- ビーズを一粒入れる
- 40 µlの0.4M NaOHを入れる
- 2000rpmで5秒オン、2秒オフのサイクルを2回行う
- 遠心(フラッシュ)
- 200 µlの0.1M Tris-HClを加える
- よく混合し、遠心(フラッシュ)
- 上清を鋳型として用いる
PCR
反応液の組成
1サンプル | |
ExTaq | 0.1 µl |
10×ExTaq Buffer | 2 µl |
2.5mM dNTP | 1.6 µl |
プライマー | 終濃度0.2 µM |
プライマー | 終濃度0.2 µM |
DNA | 1 µl |
滅菌水 | up to 20 µl |
合計 | 20 µl |
反応
- 95℃ 3分
- [95℃ 45秒、(アニーリング)55℃ 45秒、(伸長反応)72℃ 2分] のサイクルを35回
- 72℃ 5分 (→ 4℃ ∞)