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2024年3月12日 (火) 11:58時点における版
目次 |
プロトコール集
植物の育成
- シロイヌナズナ
植物の観察
クンショウモの育成
細菌の実験
DNAの実験
抽出・精製
- トマト葉からのDNA抽出方法 佐藤
- NucleoSpin Plant IIを使ったDNA抽出 下里
- エタノール沈殿
- NucleoSpin Gel and PCR Clean-upを使ったDNA精製
- NucleoSpin Plasmid Quick Pureを使ったプラスミド抽出
- NucleoSpin Plasmid EasyPureを使ったプラスミド抽出
- NucleoBond Xtra Midiを使ったプラスミド抽出 (Midi Prep.)
プラスミド作成
- 塩基置換を導入する QuickChange Multi Site-Directed Mutagenesis Kis
- インバースPCR 緋田
- TAクローニング (TArget Clone -Plus- [Toyobo])
- In-Fusion Cloning
- 大腸菌DH5aの形質転換
解析
- 制限酵素でDNAを切断する
- トマトSNPマーカーの解析
- MightyAmpを使ったPCR
- LA Taqを使ったPCR
- EmeraldAmpを使ったコロニーPCR
- BigDye Terminaterを使ったシークエンス
- シロイヌナズナのゲノム編集について：概要、変異アリルの検出・同定
定量
RNAの実験
RNAの定量方法
- (a)吸光度(UV)で測定する場合 ⇒ DNAの定量 (DS-11 FX+) を参照
- (b)蛍光色素を用いる場合 ⇒ RNAの定量 (invitrogen Quant-iT RiboGreen RNA Reagent and Kit)
タンパク質の実験
各種試薬の作製方法
- 各種試薬の作製方法（覚え書き） ：SOC培地、MES-KOH、B5 vitamin、種子滅菌液 など
次世代シーケンサー
- TruSeq Nano DNA Library Prep Kit
- NEBNext Ultra RNA Library Prep Kit
- NEBNext Ultra II RNA Library Prep Kit 丹羽(修正)
- NEBNext Multiplex Oligos for Illumina
- トマトSNPマーカーのライブラリ化
- RAD-Seqのライブラリ作成
- 長いPCR産物のライブラリ作成
データ解析
研究室のルール
実験装置の使い方
- SYNERGY H1 (プレートリーダー)
- 生物発光測定装置
コンピュータの使い方
その他
お知らせ
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